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Síndrome de microdeleção 3p25.3
ORPHA:435638CID-10 · Q93.5CID-11 · LD44.31DOENÇA RARA

Uma alteração cromossômica rara caracterizada por deficiência intelectual, epilepsia ou alterações detectadas no eletroencefalograma (EEG), dificuldade na fala, falta de coordenação dos movimentos e movimentos repetitivos das mãos.

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Introdução

O que você precisa saber de cara

📋

Uma alteração cromossômica rara caracterizada por deficiência intelectual, epilepsia ou alterações detectadas no eletroencefalograma (EEG), dificuldade na fala, falta de coordenação dos movimentos e movimentos repetitivos das mãos.

Escala de raridade

CLASSIFICAÇÃO ORPHANET · BRASIL 2024
<1 / 1 000 000
Ultra-rara
<1/50k
Muito rara
1/20k
Rara
1/10k
Pouco freq.
1/5k
Incomum
1/2k
Prevalência
0.0
Worldwide
Casos conhecidos
8
pacientes catalogados
Início
Infancy
+ neonatal
🏥
SUS: Cobertura mínimaScore: 15%
CID-10: Q93.5
🇧🇷Dados SUS / DATASUS
PROCEDIMENTOS SIGTAP (5)
0202010503
Cariótipo — bandas G, Q ou Rgenetic_test
0202010600
Pesquisa de microdeleções/microduplicações por FISHlab_test
0202010694
Sequenciamento completo do exoma (WES)rehabilitation
0202010260
Dosagem de alfa-fetoproteína
0301070040
Atendimento em reabilitação — doenças raras
Você se identifica com essa condição?
O Raras está aqui pra te apoiar — com ou sem diagnóstico

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Entender a doença

Do básico ao detalhe, leia no seu ritmo

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Sinais e sintomas

O que aparece no corpo e com que frequência cada sintoma acontece

Partes do corpo afetadas

😀
Face
10 sintomas
🦴
Ossos e articulações
8 sintomas
🧠
Neurológico
7 sintomas
❤️
Coração
2 sintomas
👂
Ouvidos
2 sintomas
💪
Músculos
2 sintomas

+ 19 sintomas em outras categorias

Características mais comuns

90%prev.
Atraso motor
Muito frequente (99-80%)
55%prev.
Maneirismos repetitivos anormais
Frequente (79-30%)
55%prev.
Hipotonia
Frequente (79-30%)
55%prev.
Ponte nasal deprimida
Frequente (79-30%)
55%prev.
Nariz proeminente
Frequente (79-30%)
55%prev.
Filtro labial profundo
Frequente (79-30%)
51sintomas
Muito frequente (1)
Frequente (9)
Ocasional (41)

Os sintomas variam de pessoa para pessoa. Abaixo estão as 51 características clínicas mais associadas, ordenadas por frequência.

Atraso motorMotor delay
Muito frequente (99-80%)90%
Maneirismos repetitivos anormaisAbnormal repetitive mannerisms
Frequente (79-30%)55%
HipotoniaHypotonia
Frequente (79-30%)55%
Ponte nasal deprimidaDepressed nasal bridge
Frequente (79-30%)55%
Nariz proeminenteProminent nose
Frequente (79-30%)55%

Linha do tempo da pesquisa

Publicações por ano — veja quando o interesse científico cresceu
Anos de pesquisa1
Últimos 10 anos1publicações
Pico20251 papers
Linha do tempo
2025Hoje · 2026
Publicações por ano (últimos 10 anos)

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Genética e causas

O que está alterado no DNA e como passa nas famílias

Genes associados

2 genes identificados com associação a esta condição. Padrão de herança: Not applicable.

SETD5Histone-lysine N-methyltransferase SETD5Role in the phenotype ofAltamente restrito
FUNÇÃO

Chromatin regulator required for brain development: acts as a regulator of RNA elongation rate, thereby regulating neural stem cell (NSC) proliferation and synaptic transmission. May act by mediating trimethylation of 'Lys-36' of histone H3 (H3K36me3), which is essential to allow on-time RNA elongation dynamics. Also monomethylates 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me1) in vitro. The relevance of histone methyltransferase activity is however subject to discussion

LOCALIZAÇÃO

NucleusChromosome

MECANISMO DE DOENÇA

Intellectual developmental disorder, autosomal dominant 23

A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. MRD23 patients manifest moderate to severe intellectual disability with additional variable features of brachycephaly, a low hairline, depressed nasal bridge, prominent high nasal root, tubular nose, upslanting palpebral fissures, long and smooth philtrum, micrognathia, thin upper lip, and crowded teeth. Behavioral problems, including obsessive-compulsive disorder, hand flapping with ritualized behavior, and autism, are prominent features.

EXPRESSÃO TECIDUAL(Ubíquo)
Cerebelo
79.4 TPM
Cérebro - Hemisfério cerebelar
74.8 TPM
Útero
61.3 TPM
Ovário
58.7 TPM
Cervix Endocervix
57.4 TPM
INTERAÇÕES PROTEICAS (2)
OUTRAS DOENÇAS (3)
intellectual disability-facial dysmorphism syndrome due to SETD5 haploinsufficiencycomplex neurodevelopmental disorder3p25.3 microdeletion syndrome
HGNC:25566UniProt:Q9C0A6
BRPF1PeregrinRole in the phenotype ofAltamente restrito
FUNÇÃO

Scaffold subunit of various histone acetyltransferase (HAT) complexes, such as the MOZ/MORF and HBO1 complexes, which have a histone H3 acetyltransferase activity (PubMed:16387653, PubMed:24065767, PubMed:27939640). Plays a key role in HBO1 complex by directing KAT7/HBO1 specificity towards histone H3 'Lys-14' acetylation (H3K14ac) (PubMed:24065767). Some HAT complexes preferentially mediate histone H3 'Lys-23' (H3K23ac) acetylation (PubMed:27939640). Positively regulates the transcription of RU

LOCALIZAÇÃO

NucleusChromosomeCytoplasm

VIAS BIOLÓGICAS (2)
Regulation of TP53 Activity through AcetylationHATs acetylate histones
MECANISMO DE DOENÇA

Intellectual developmental disorder with dysmorphic facies and ptosis

An autosomal dominant neurodevelopmental disorder characterized by delayed psychomotor development, intellectual disability, delayed language, and facial dysmorphisms, most notably ptosis. Additional features may include poor growth, hypotonia, and seizures.

OUTRAS DOENÇAS (2)
intellectual developmental disorder with dysmorphic facies and ptosis3p25.3 microdeletion syndrome
HGNC:14255UniProt:P55201

Variantes genéticas (ClinVar)

860 variantes patogênicas registradas no ClinVar.

🧬 SETD5: NM_001080517.3(SETD5):c.2126A>G (p.Asn709Ser) ()
🧬 SETD5: NM_001080517.3(SETD5):c.2672C>T (p.Pro891Leu) ()
🧬 SETD5: NM_001080517.3(SETD5):c.2816C>T (p.Ser939Leu) ()
🧬 SETD5: NM_001080517.3(SETD5):c.2254C>G (p.Pro752Ala) ()
🧬 SETD5: NM_001080517.3(SETD5):c.2566C>G (p.Pro856Ala) ()
Ver todas no ClinVar

Vias biológicas (Reactome)

2 vias biológicas associadas aos genes desta condição.

Diagnóstico

Os sinais que médicos procuram e os exames que confirmam

Carregando...

Tratamento e manejo

Remédios, cuidados de apoio e o que precisa acompanhar

Carregando informações de tratamento...

Onde tratar no SUS

Hospitais de referência no Brasil e o protocolo oficial do SUS (PCDT)

🇧🇷 Atendimento SUS — Síndrome de microdeleção 3p25.3

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Pesquisa ativa

Ensaios clínicos abertos e novidades científicas recentes

Pesquisa e ensaios clínicos

Nenhum ensaio clínico registrado para esta condição.

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Publicações mais relevantes

Timeline de publicações
0 papers (10 anos)
#1

Epileptic seizures and EEG findings in 3p deletion syndrome involving SLC6A1.

European journal of medical genetics2025 Aug

3p Deletion syndrome is a rare genetic disorder characterized by intellectual disability, growth delay, hypotonia, and distinctive facial features, with considerable phenotypic variability. Previous reports have highlighted the significance of deletions within the 3p25.3 region contributing to the development of Angelman-like features, such as stereotypic movements, a happy demeanor, epilepsy, and characteristic electroencephalogram (EEG) patterns. This study analyzed 22 patients of 3p deletion syndrome, focusing on epilepsy and EEG findings. A newly defined short smallest region of overlap (sSRO) within 3p25.3, encompassing approximately 52 kb and partially including SLC6A1 and SLC6A11, was associated with Angelman-like features, particularly epilepsy and EEG patterns. Patients with sSRO deletions exhibited a high incidence of seizures (60 %), characterized by myoclonic or absence seizures, with EEG showing generalized high-amplitude slow waves. In contrast, larger deletions beyond the sSRO were linked to dysmorphological features of 3p-syndrome, generalized tonic-clonic seizure, and non-specific EEG findings. These findings suggest that SLC6A1 dysfunction contributes to epilepsy and EEG abnormalities, possibly via impaired GABA transport, whereas patients with larger or non-overlapping deletions exhibited more typical 3p-syndrome features, suggesting that multiple neurological genes in the broader deletion region may independently contribute to more severe neurological phenotypes. In conclusion, it is important to consider GABA-related disorders, including a specific chromosomal abnormality known as 3p-syndrome with a microdeletion in the SRO region, when observing characteristic epilepsy and EEG findings resembling Angelman syndrome.

Publicações recentes

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Associações

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Referências e fontes

Bases de dados externas citadas neste artigo

Publicações científicas

Artigos indexados no PubMed ligados a esta doença no grafo RarasNet — título, periódico e PMID direto da fonte, sem intermediação de IA.

  1. Epileptic seizures and EEG findings in 3p deletion syndrome involving SLC6A1.
    European journal of medical genetics· 2025· PMID 40517887mais citado
  2. Mast cell mediators in hereditary angioedema.
    Orphanet J Rare Dis· 2026· PMID 41832580recente
  3. Prenatal Molecular Diagnosis of COL2A1-Associated Stickler Syndrome: Genotype-Phenotype Correlation in a Resource-Limited Healthcare Setting.
    Int J Mol Sci· 2026· PMID 41828453recente
  4. Platelet gene signatures detecting pulmonary artery stenosis in patients with pulmonary hypertension.
    Orphanet J Rare Dis· 2026· PMID 41827036recente
  5. The global impact of imiglucerase therapy in children with Gaucher disease types 1 and 3: a real-world analysis from the International Collaborative Gaucher Group Gaucher Registry.
    Orphanet J Rare Dis· 2026· PMID 41821052recente
  6. Monogenic lupus with SLC7A7 mutations: a retrospective study from a Chinese center.
    Orphanet J Rare Dis· 2026· PMID 41821046recente

Bases de dados e fontes oficiais

Identificadores e referências canônicas usadas para montar este verbete.

  1. ORPHA:435638(Orphanet)
  2. MONDO:0018564(MONDO)
  3. GARD:21813(GARD (NIH))
  4. Variantes catalogadas(ClinVar)
  5. Busca completa no PubMed(PubMed)
  6. Q55788181(Wikidata)

Dados compilados pelo RarasNet a partir de fontes abertas (Orphanet, OMIM, MONDO, PubMed/EuropePMC, ClinicalTrials.gov, DATASUS, PCDT/MS). Este conteúdo é informativo e não substitui avaliação médica.

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Compêndio · Raras BR

Síndrome de microdeleção 3p25.3

ORPHA:435638 · MONDO:0018564
Prevalência
<1 / 1 000 000
Casos
8 casos conhecidos
Herança
Not applicable
CID-10
Q93.5 · Outras deleções parciais de cromossomo
CID-11
Início
Infancy, Neonatal
Prevalência
0.0 (Worldwide)
MedGen
UMLS
C5437630
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